La capacidad asimilativa es definida como la capacidad de un cuerpo de agua para "aceptar" y "degradar" sustancias orgánicas a través de procesos naturales físicos, químicos o biológicos, manteniendo el oxígeno disuelto a niveles adecuados para los usos designados de ese cuerpo de agua, como usualmente ha sido establecido por los estándares de calidad de agua.
Inherente a esta evaluación es la inclusión de varios fenómenos tales como nitrificación, reaeración, demanda bentónica de oxígeno disuelto, fotosíntesis y respiración de algas, etc. El metabolismo microbiano es el conjunto de procesos por los cuales un microorganismo obtiene la energía y los nutrientes (carbono, por ejemplo) que necesita para vivir y reproducirse. Los microorganismos utilizan numerosos tipos de estrategias metabólicas distintas y las especies pueden a menudo distinguirse en base a estas estrategias. Las características metabólicas específicas de un microorganismo constituyen el principal criterio para determinar su papel ecológico, su responsabilidad en los ciclos biogeoquímicos y su utilidad en los procesos industriales.